Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KDELR1P24390 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms