Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK11BP21127 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK11BP21127 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms