Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms