Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CTRB1P17538 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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