Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPB42P16452 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms