Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CETPP11597 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CETPP11597 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CETPP11597 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms