Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTNSO60931 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTNSO60931 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms