Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTSVO60911 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTSVO60911 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTSVO60911 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTSVO60911 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSVO60911 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSVO60911 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSVO60911 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTSVO60911 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTSVO60911 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms