Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TO15178 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TO15178 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TO15178 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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