Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SYNJ2O15056 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYNJ2O15056 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms