Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
BCKDKO14874 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BCKDKO14874 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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