Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTDSP2O14595 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms