Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C4orf47A7E2U8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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C4orf47A7E2U8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf47A7E2U8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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