Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms