Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
LINC00312Q9Y6C7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms