Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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