Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
IGSF9BQ9UPX0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms