Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAK1Q9UPV9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms