Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AGAP1Q9UPQ3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AGAP1Q9UPQ3 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms