Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB23Q9ULC3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB23Q9ULC3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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