Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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RABGEF1Q9UJ41 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RABGEF1Q9UJ41 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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