Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPG2Q9UBF2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COPG2Q9UBF2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms