Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms