Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDP1Q9NUW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDP1Q9NUW8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDP1Q9NUW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDP1Q9NUW8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TDP1Q9NUW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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