Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms