Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL7

WDR12, Ribosome biogenesis protein WDR12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR12Q9GZL7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
WDR12Q9GZL7 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms