Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHL4Q9C0H6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms