Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CEP44Q9C0F1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CEP44Q9C0F1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms