Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCGF6Q9BYE7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms