Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SNHG12Q9BXW3 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms