Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms