Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PI4K2AQ9BTU6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms