Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MRVI1-201ENST00000423302 6126 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RETNLBQ9BQ08 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms