Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDK5RAP3Q96JB5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDK5RAP3Q96JB5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms