Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COG3Q96JB2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COG3Q96JB2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms