Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC97Q96F63 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC97Q96F63 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC97Q96F63 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC97Q96F63 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC97Q96F63 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC97Q96F63 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms