Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIRT1Q96EB6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms