Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TMCO6Q96DC7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms