Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GIPC3Q8TF64 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GIPC3Q8TF64 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms