Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MCOLN3Q8TDD5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms