Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHE22Q8NFJ8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BHLHE22Q8NFJ8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms