Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AMER3Q8N944 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms