Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms