Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CBLN3Q6UW01 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms