Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAF7Q6Q0C0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms