Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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C9orf135Q5VTT2 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
C9orf135Q5VTT2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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