Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5B1Q2VPB7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms