Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL40Q2TBA0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHL40Q2TBA0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms