Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PDK4Q16654 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms