Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ECM1Q16610 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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